莆头作业区有1#— 25#多用途泊位，大可靠泊7万吨级船舶，由码头作业区、港口支持系统区、港口商务区、物流园区、临港工业区和预留港口工业区组成。一期先行投产1#— 2＃泊位，可靠泊7万吨级船舶，配备40万平方的堆场、仓库，主要从事散货、集装箱、木材、浆泊等货物装卸、堆存业务，并通过莆头作业区完善路网与内陆工业企业形成无缝对接。